Korkeammat alkukustannukset: Perinteisiin katolla oleviin aurinkopaneeleihin verrattuna aurinkokattotiileillä on usein korkeammat alkuinvestointikustannukset.
Hieman alhaisempi energiatehokkuus: Aurinkolakattotiilien energian muuntotehokkuus voi tyypillisesti olla hieman pienempi kuin tavallisten aurinkomoduulien.
Asennuspalvelujen niukkuus: Tällä hetkellä aurinkokattotiilien asennuspalveluita tarjoavia yrityksiä on suhteellisen vähän, mikä saattaa aiheuttaa hankaluuksia asennuksen aikana.